"Flower" đã ra mắt ở vị trí thứ 2 trên bảng xếp hạng Billboard Global 200 với khoảng hơn 108,7 triệu lượt phát trực tuyến và hơn 21.000 lượt tải xuống đã được bán trên toàn cầu, đánh dấu ca khúc solo đầu tiên của Jisoo lọt vào top 10 trên bảng xếp hạng. Bài hát đã giành được lượt phát trực tuyến lớn thứ ba của một nữ nghệ sĩ chỉ đứng sau thành viên cùng ban nhạc là Lisa với bài hát "Lalisa" và Olivia Rodrigo qua bài hát "Drivers License". Bài hát cũng đã ra mắt ở vị trí thứ 2 trên bảng xếp hạng Billboard Global Excl. U.S. với hơn 103,3 triệu lượt phát trực tuyến và hơn 16.000 lượt tải xuống được bán tại bên ngoài Hoa Kỳ, đánh dấu kỷ lục bài hát lọt top 10 đầu tiên của Jisoo trên bảng xếp hạng lần thứ hai.[19] Đồng thời đưa Jisoo trở thành nữ nghệ sĩ solo thứ 3 của K-pop lọt vào top 10 trên bảng xếp hạng toàn cầu, chỉ đứng sau 2 thành viên cùng nhóm là Rosé và Lisa.[20]

Tại Hàn Quốc, "Flower" đã ra mắt tại vị trí thứ 33 trong tuần phát hành thứ 13 (26 tháng 3 – 1 tháng 4) của bảng xếp hạng Circle, trong vòng chưa đầy 2 ngày.[21] Trong tuần tiếp theo, bài hát đã tăng lên vị trí thứ 2 trong khoảng thời gian từ ngày 2 tháng 4 đến ngày 8 tháng 4, đánh dấu bài hát solo đầu tiên của cô lọt vào top 10.[22] Tại Vương quốc Anh, "Flower" đã ra mắt ở vị trí thứ 38 trên bảng xếp hạng UK Singles Chart, trở thành bài hát có thứ hạng cao nhất và là ca khúc lọt vào top 40 đầu tiên của một nữ nghệ sĩ solo K-pop trên bảng xếp hạng.[23][24] Tại New Zealand, bài hát đã ra mắt ở vị trí thứ 40 trên bảng xếp hạng NZ Singles Chart, trở thành bài hát lọt vào top 40 đầu tiên của một nữ nghệ sĩ solo Hàn Quốc. Tại Canada, bài hát đã ra mắt ở vị trí thứ 30 trên bảng xếp hạng Canadian Hot 100, trở thành bài hát K-pop có thứ hạng cao nhất của một nữ nghệ sĩ solo K-pop tại quốc gia này. Tại Hoa Kỳ, mặc dù "Flower" đã không ra mắt trên bảng xếp hạng Billboard Hot 100, nhưng đĩa đơn đã lọt vào bảng xếp hạng Bubling Under Hot 100 tại vị trí thứ 4 và giành được vị trí thứ 10 trên bảng xếp hạng Billboard Digital Song Sales và vị trí thứ 2 trên bảng xếp hạng Billboard World Digital Song Sales với hơn 6.000 lượt tải xuống đã được bán ra.[25] Với những thành tích này, Jisoo đã trở thành một trong 5 nữ nghệ sĩ solo K-pop giành được top 10 bản hit trên bảng xếp hạng Digital Song Sales, đứng sau các thành viên cùng nhóm của cô là Rosé và Lisa cũng như là Youjeen và So-yoon.[26][27]